経歴
- 2017/03
- 神戸大学 工学部 応用化学科 卒業
- 2019/03
- 神戸大学 大学院 工学研究科 応用化学専攻 博士課程前期課程修了
- 2023/03
- 神戸大学 大学院 工学研究科 応用化学専攻 博士課程後期課程修了
- 2023/04
- 医薬基盤・健康・栄養研究所 AI健康・医薬研究センター 特任研究員
- 2025/04
- 神戸大学 大学院 科学技術イノベーション研究科 特命助教
受賞等
- 2021/10 最優秀ポスター賞「酵素反応予測のための機械学習モデルの開発」（第1回神戸大学先端バイオ工学研究センター成果発表会）
発表論文
- Yoshizaki, M., Kuriya, Y., Yamamoto, M., Watanabe, N., Araki, M. (2024/06) Development of method using language processing techniques for extracting information on drug–health food product interactions, British Journal of Clinical Pharmacology, 90(6), 1514-1524
- Watanabe, N., Yamamoto, M., Murata, M., Kuriya, Y., Araki, M. (2023/11) EnzymeNet: residual neural networks model for Enzyme Commission number prediction, Bioinformatics Advances, 3(1), 173
- Watanabe, N., Kuriya, Y., Murata, M., Yamamoto, M., Shimizu, M., Araki, M. (2023/05) Different Recognition of Protein Features Depending on Deep Learning Models: A Case Study of Aromatic Decarboxylase UbiD, Biology, 12(6), 795
- Kuriya, Y., Murata, M., Yamamoto, M., Watanabe, N., Araki, M. (2023/05) Prediction of Metabolic Flux Distribution by Flux Sampling: As a Case Study, Acetate Production from Glucose in Escherichia coli, Bioengineering, 10(6), 636
- Watanabe, N., Yamamoto, M., Murata, M., Vavricka, C. J., Ogino, C., Kondo, A., Araki, M. (2022/09) Comprehensive Machine Learning Prediction of Extensive Enzymatic Reactions, The Journal of Physical Chemistry B, 126(36), 6762-6770
- Vavricka, C. J., Takahashi, S., Watanabe, N., Takenaka, M., Matsuda, M., Yoshida, T., Suzuki, R.,他8名. (2022/03) Machine learning discovery of missing links that mediate alternative branches to plant alkaloids, Nature Communications, 13, 1405
- Watanabe, N., Murata, M., Ogawa, T., Vavricka, C. J., Kondo, A., Ogino, C., Araki, M. (2020/03) Exploration and Evaluation of Machine Learning-Based Models for Predicting Enzymatic Reactions, Journal of Chemical Information and Modeling, 60(3), 1833-1848
著書
- 渡邉直暉，荒木通啓，微生物を用いた有用物質生産技術の開発「計算科学を用いた酵素の探索・改良技術」, 技術情報協会(2024/06)
- 渡邉直暉，荒木通啓，微生物を活用した有用物質の製造技術「スマートセルの効率的創製に向けた情報解析技術とAI活用」, シーエムシー出版(2023/05)