setvarは既にSAC本体のcompile時に使ったものをコピーして一部修正して使います。SACFFLAGSをいじるだけです。
<修正前>
setenv SACDIR /usr/local/sac
setenv SACCFLAGS "-w -DBSD -I/usr/X11/include -I/usr/include/bsd"
setenv SACFFLAGS "-w -N n2000 -N q300"
setenv SACPFLAGS "-P"
setenv SACXWINDOWS x11
setenv SACSUNWINDOWS 0
setenv X11LIBDIR /usr/X11/lib
↓
<修正後>
setenv SACDIR /usr/local/sac
setenv SACCFLAGS "-w -DBSD -I/usr/X11/include -I/usr/include/bsd"
setenv SACFFLAGS "-w" (←ここ!)
setenv SACPFLAGS "-P"
setenv SACXWINDOWS x11
setenv SACSUNWINDOWS 0
setenv X11LIBDIR /usr/X11/lib